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拜谱新品发布| 免疫肽组,基于质谱的新生抗原鉴定与筛选

发布时间:2024-09-26
T上皮上皮内部都可以设别淋巴良性肺部恶性肿瘤上皮上皮内部外表的重点公司化相匹配性复合型体(MHC)呈递的抗原而启用免疫公司性力反應。MHC I类(MHC-I)氧原子核与CD8+ T上皮上皮内部上下级功用,其呈递的肽重点特征于内源性胞质蛋清的蛋清酶体可降解塑料,而MHC II类(MHC-II)氧原子核重点展示于靠谱抗原提呈上皮上皮内部,与CD4+ T上皮上皮内部上下级功用,其呈递的肽存在根据内体路经可降解塑料的胞外和胞内蛋清(图1)。所以,设别由MHC氧原子核呈递的淋巴良性肺部恶性肿瘤抗原在结构设计依耐T上皮上皮内部设别和毒杀淋巴良性肺部恶性肿瘤上皮上皮内部的效果和的安全的癌症晚期免疫公司性力治疗是重要的的。为质谱(MS)的免疫公司性力肽组学(Immunopeptidomics)都可以从多上皮上皮内部系、淋巴良性肺部恶性肿瘤公司化和健康生活公司化中高通芯片量、马上鉴别MHC结合实际肽。

拜谱生物全新推出免疫肽组拜谱生物,通过MHC表面抗原含有MHC基本融入肽,使用Orbitrap Astral全新一代高分辨质谱仪检测,直接得到免疫细胞肽字段及其翻译专业后遮盖产品信息,提高基因测序的真实度,并采用De novo从早测序技术设备,不依赖现有数据库,比较高通量鉴定出MHC上呈递的多肽,发现更多非典型免疫肽,而且高的数据表格进行分析相关内容为医学研究中的新抗原鉴定、免疫治疗和疫苗开发提供支持。欢迎大家咨询!

图1 MHC-I和MHC-II呈递良性肿瘤抗原的条件

(图源:Xie et al.Signal Transduction Targeted Ther. 2023)

NO.1 研究注意事项

NO.2 类产品特征

NO.3 深入分析资源(个部分)

NO.4 送样小编建议

真实案例分折

01 机能探索

内容之类:The nuclear export protein XPO1 provides a peptide ligand for natural killer cells

发稿期刊:Science Advances IF:11.7 2024

XPO1 (Exportin-1/CRM1)是种核输送蛋清,在癌病中频繁过形容,做以为肺部肿瘤再次发生的控制问题。迄今为止,靶向疗法XPO1的小大分子正被可作药学治疗癌症抗癫痫药物。

作者发现XPO1是自然杀伤(NK)细胞的靶标。利用免疫系统肽组学,作者鉴定出一种衍生自XPO1的肽,它可以在人类白细胞抗原- C的背景下被激活的NK细胞受体KIR2DS2识别。该肽可以内源性加工并通过该受体特异性地激活NK细胞。虽然XPO1在癌症中的高表达通常与不良预后相关,但研究发现,如果有NK细胞浸润的证据,特异性癌症(如肝细胞癌)的预后可以大大改善。因此,作者确定XPO1是NK细胞识别的真正的肿瘤抗原,为NK细胞治疗实体瘤的个性化方法提供了机会。

图2 某种起源于XPO1的肽是KIR2DS2的配体

(图源:Blunt, Matthew D et al.,Sci Adv. 2024)

02 癌肿-免疫细胞医治

文章标题题目的:Development of mesothelioma-specific oncolytic immunotherapy enabled by immunopeptidomics of murine and human mesothelioma tumors

撤稿刊物:Nature Communications IF:16.6 2023

恶性瘤胸膜间皮瘤(MPM)有的是种效果较差的侵蚀性肉瘤。是由于原有的调理方案设计缺少成效,因而亟待解决须得新的调理战略。长期以来其T细胞系侵润,作著假设检验MPM有的是个靠谱的调理性肺癌防疫针的目标值。

迄今为止,对间皮瘤的研究一直集中在识别分子标记以更好地对该疾病进行分类和表征,对涉及细胞毒性(CD8+) T细胞的治疗靶点知之甚少。在这项研究中,作者利用应用场景质谱的天然免疫肽组研究了小鼠(AB12细胞系)和人细胞系(H28、MSTO-211H、H2452和JL1)以及患者原发性肿瘤中MPM的抗原呈递景观。作者使用来自人类健康供体和癌症患者的T细胞体外表征了洗脱肽的免疫原性特征。此外,作者选择最有前景的肽搭配PeptiCRAd方法,在雌性小鼠的间皮瘤小鼠模型中测试其疗效。总的来说,作者证明了免疫肽组学分析与溶瘤免疫疗法相结合的使用代表了一种解决不可治疗肿瘤的可行且有效的策略。

图3 恶变胸膜间皮瘤免疫细胞肽组学检则

(图源:Chiaro, Jacopo et al.,Nat Commun. 2023)

03 菌类mRNA接种疫苗联合开发

论文主题 :Immunopeptidomics-based design of mRNA vaccine formulations against Listeria monocytogenes

撤稿杂志社:Nature Communications IF:16.6 2023

单核细胞增生李斯特菌是一种导致人类李斯特菌病的食源性细胞内细菌病原体。尽管死亡率高且抗生素耐药性增加,但仍没有临床批准的针对李斯特菌的疫苗可用。为了鉴定新的抗原,作者通过为质谱的抗体肽组学来筛选呈现在受感染的人类细胞系表面的李斯特菌肽。在超过15000种人类自身肽中,作者检测到来自42种不同细菌蛋白的68种李斯特菌免疫肽,包括几种已知抗原。呈现在不同细胞系上的肽通常来自相同的细菌表面蛋白,将这些抗原归类为潜在的候选疫苗。在脂质纳米粒mRNA疫苗制剂中编码这些高度呈递的抗原导致特异性CD8+ T细胞应答,并在小鼠的疫苗接种攻击实验中诱导保护。研究结果可以作为开发针对李斯特菌的临床mRNA疫苗的起点,证明了基于质谱的免疫肽组学在下一代细菌疫苗开发中的作用。

图4 在李斯特菌染上的Hela体细胞膜和HCT-116体细胞膜中司法鉴定MHC I呈递的抗原肽。

(图源:Mayer, Rupert L et al.,Nat Commun. 2022)

拜谱总结ppt

天然免疫力检测检测力力力肽组学是蛋白酶酶质组学的同一个怏速成长的旁支,它潜心于研究探讨天然免疫力检测检测力力力软件中由核心公司相匹配性分手后复合体(MHC)或人类白癌血内部抗原(HLA)原子核呈递的天然免疫力检测检测力力力肽。这类天然免疫力检测检测力力力肽是癌血内部界面呈递的肽段,就可以被T癌血内部认别,若想开启天然免疫力检测检测力力力想法。体系结构质谱的天然免疫力检测检测力力力肽组学早就当上亲子签定MHC蛋白酶酶呈递肽的金的标准步骤,就可以进行亲子签定各种与众不同生理变化和病理报告心态下各种与众不同公司和癌血内部多种类型中的天然免疫力检测检测力力力肽组,列举片体瘤或hiv病毒妇科感染的癌血内部。

拜谱生物作为国内领先的多组学公司,可提供完善成熟的淀粉酶组学、分泌组学、转录组学等多组学产品技术服务体系。全新推出的免疫系统肽组在线检测的服务,通过MHC抗体特异性富集,高分辨质谱检测结合De novo从头测序技术,能够为准且直观具备天然天然免疫肽队列,出现 更好地非主要天然天然免疫肽,逐层淘汰出可靠性新抗原,有助于医学研究人员理解免疫系统的机制、开发疫苗、个性化癌症免疫疗法以及深入了解各种疾病的发病机制。

基准文献综述

1. Xie N,Shen G,Gao W, et al. Neoantigens: promising targets for cancer therapy. Signal Transduct Target Ther. 2023;8 (1):9. doi:10.1038/s41392-022-01270-x 2. Blunt MD,Fisher H,Schittenhelm RB, et al. The nuclear export protein XPO1 provides a peptide ligand for natural killer cells. Sci Adv. 2024;10 (34):eado6566. doi:10.1126/sciadv.ado6566 3. Chiaro J,Antignani G,Feola S, et al. Development of mesothelioma-specific oncolytic immunotherapy enabled by immunopeptidomics of murine and human mesothelioma tumors. Nat Commun. 2023;14 (1):7056. doi:10.1038/s41467-023-42668-7 4. Mayer RL,Verbeke R,Asselman C, et al. Immunopeptidomics-based design of mRNA vaccine formulations against Listeria monocytogenes. Nat Commun. 2022;13 (1):6075. doi:10.1038/s41467-022-33721-y
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