草酸钙（CaOx）肾结石是泌尿平台最易见的的疾病这其中之一。肾聚集中CaOx纳米线过饱和沉淀会造成的肾小管癌细胞直接损伤和凋亡，引起造成的肾结石的形成了。短链皮脂酸由肠子内水解酸化池结核杆菌发哮营养膳食弹性纤维出现，不只是在边缘肠子深层中充分调动能力，还有在平台含量上也充分调动首要能力。这其中，丁酸是最雄厚的短链皮脂酸，体现了消除炎症和免疫细胞能够抑制能力,本调查浅论丁酸对CaOx肾结石的能力举例内在的靶点。

围绕草酸钙肾结石相关机制研究，华山大医院泌尿整形外科吴忠教导、周子健博土于今年5月在Chem Biol Interact发表了相关成果，7月4日该团队又有一篇新作发表。吴忠传授、周子健教授在Food and Chemical Toxicology（IF=4.3）上发表题为“Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9”的研究文章。研究人员发现丁酸在体外和体内均能抑制CaOx肾结石模型的氧化应激和炎症损伤，并利用网络药理学预测发现CYP2C9是丁酸影响CaOx肾结石的靶基因，最后通过细胞实验证实CYP2C9在草酸诱导的HK-2细胞损伤模型中的作用。拜谱生物工程与吴忠教授、周子健博士团队再次合作，提供了网络上药学学保障，助力预测CYP2C9是丁酸影响CaOx肾结石的潜在靶点，为丁酸预防CaOx肾结石产生的临床应用奠定理论基础。

论文种类：Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9（Food Chem Toxicol.，IF=4.3，2023.07） 客机关单位：华山医院医生 研发对方：大鼠、HK-2细胞系 排列信息内容：比对组（Con）、三维模型组（Model）和丁酸钠组（NaB） 拜谱展示 技艺：网上药剂学学加测

基本思路具体步骤图

研发导致

探析人第一步建设方案大鼠模式化，凭借生理方面生化模式完成指标和企业病理学学着色等探析机制发觉丁酸可才能减少CaOx模式化大鼠肾CaOx结晶体的转变成和板材损害，提升CaOx模式化大鼠的感染板材损害和腐蚀物质的过激表达出。前者，丁酸还可控制草酸引发的HK-2人体细胞核板材损害、腐蚀应激状态和人体细胞核凋亡。 为蜡烛燃烧实验丁酸机构和靶DNA网路信息，理论研究师从PubChem修改丁酸和丁酸酯的二维和二维机构（图1A）。采取PharmMapper统计资料表格统计库和Uniprot统计资料表格统计库处里后共淘汰出11七个丁酸靶DNA供进步骤剖析。将DNA目录引入STRING统计资料表格统计库，采取PPI网路信息剖析。Cytoscape提供了排顺的前20的交通核心区靶DNA的基本网路信息图，或者CYP2C9、CASP3、MAPK14、ALB、HRAS、ABL、RARA、RARG、RXRB、PRKACA、NOS3、SRC、MMP9、KDR、HSP90AA1、HPGDS、GSTA3、GSTA1、GSR和GSTM2（图1B）。那些交通核心区DNA与网路信息中的其余DNA均展现出一段的相关联的性，详细说明那些DNA很有可能引领着联合用途。GO和KEGG剖析阐明了丁酸交通核心区DNA的相关联的路经和生态学学效果（图1C）。交通核心区DNA注意与类固醇雌的激素回应、氧化物物应激响应性回应、抗逆性氧细胞核对类固醇雌的激素刺激的作用的影响或者对呈酸性化学上的成分的影响关于。结合以上根据上述，那些交通核心区DNA注意进入了氧化物物应激响应性和对抗逆性氧的生态学影响过程中 ，是肾结石确立制度中至关关键的路经，这得出结论丁酸很有可能在肾结石中引领关键用途。

图1| 丁酸结构特征与靶基因遗传网络上数据分析(图源：Zijian Zhou., et al., Food Chem Toxicol.

为进1步探究丁酸对CaOx肾结石真是切靶人类遗传染色体组组组，研发人数巧用GEO统计资料库对GSE73680中正常对应与CaOx肾结石自身的人类遗传染色体组组组不同之处使用了研发。对应组与CaOx结石自身的相应的系数性性不同之处抒发人类遗传染色体组组组（DEGs）筛分标准规定为P < 0.05、|log2(FC)| > 1。共筛分到3783个人类遗传染色体组组组产生相应的系数性變化，之中3379个（89.4%）人类遗传染色体组组组抒发上涨，404个（10.6%）人类遗传染色体组组组抒发调低（图2A）。对DEGs使用聚类算法了解了解，热图表明了前10个被选中DEGs的二维分段聚类算法了解表现形式（图2B）。随后不久，研发人数可以通过GeneCards统计资料库劳动力检测了370个可能会与CaOx肾结石相应的的人类遗传染色体组组组，排名第一前20位的预侧人类遗传染色体组组组非常相应的性评分标准如同2C下图。从而寻找到丁酸医治CaOx肾结石的关键性靶点，研发人数将PharmMapper中的丁酸靶点、GEO中的DEGs和GeneCards中的CaOx肾结石相应的人类遗传染色体组组组外理有半个个Venn图。终究，CYP2C9被确立为丁酸反应CaOx肾结石的暗藏靶点(图2D)。除此之外，研发人数还使用了丁酸与CYP2C9的原子核联结，CYP2C9的三胺基酸残基ASN-474、LYS-48和GLY-46与丁酸上下级的作用，氢键能为4.2 kcal/mol（图2E）。 在采用网洛药剂学学精准预测CYP2C9是丁酸引响CaOx肾结石的靶基因遗传后，探索员还进行受损细胞膜实验操作印证了CYP2C9可较低草酸介导的HK-2受损细胞膜的ROS含量、真菌感染神经损伤和凋亡。

图2| 大多据库合力分享精准预测CYP2C9是丁酸用于CaOx肾结石的靶表观遗传

学习結果

本探讨一开始察觉到丁酸在身体之外和胃中均能减缓CaOx肾结石型号的阳极脱色应激性状态和发炎断裂，接着随后实现网上临床药理学学筛分达到丁酸影晌CaOx肾结石的暗藏靶点——CYP2C9，在最后实现肿瘤组织细胞进行实验否认CYP2C9在草酸盐诱导性的HK-2肿瘤组织细胞ROS横向、发炎断裂和凋亡。等察觉到得出结论丁酸概率实现减缓CYP2C9来减缓CaOx肾结石的阳极脱色应激性状态，减弱发炎断裂。该流程中拜谱微生物制品打造了网上临床药理学学枝术贴心服务管理，前者拜谱微生物制品可增强稳定进一步完善的基因遗传组学、血清质组学、代谢率组学等两组学货品及枝术贴心服务管理，欢迎语呼叫联系！ 参考价值论文资料：Zhou Z, Zhou X, Zhang Y, Yang Y, Wang L, Wu Z. Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9. Food Chem Toxicol. 2023 Aug. doi: 10.1016/j.fct.2023.113925.