
近日,扬州医科本科大学第一次所属青岛博士整形医院医院王学浩工程院院士专业团体在Cancer Letters上发表了“O-GlcNAcylation of YBX1 drives a glycolysis-histone lactylation feedback loop in hepatocellular carcinoma”的研究论文。该研究建立了一个涉及YBX1糖酵解和H3K18乳酸化的正反馈循环,从而加速了HCC的进展。破坏这种反馈循环可能为HCC提供一种新的治疗策略。拜谱生物为该研究提供了转录组测序,淀粉酶互作组和靶向治疗能量转换细胞代谢检测分析服务。
用英文怎么说题目:O-GlcNAcylation of YBX1 drives a glycolysis-histone lactylation feedback loop in hepatocellular carcinoma(Cancer Letters IF:10.1)
中文字幕题头:YBX1的O-乙酰葡糖胺化修饰驱动肝细胞癌中糖酵解-组蛋白乳酸化反馈环路
合作方企事业单位:南京医科大学
科学研究村料:细胞
拜谱作为服务性:转录组测序+核蛋白互作组+靶向药物能源基础代谢组
工艺途径:
研究分析但是
01、YBX1被技术鉴定为HCC中糖酵解的重点人类基因
本探究收集HCC肿癌样本量(n=7)的单生殖体细胞膜RNA测序资料集通过浅析一下,看见糖酵解活力性其主要密集在肿癌生殖体细胞膜中,hdWGCNA浅析一下区分出9个dna板块(图1A-G)。TCGA-LIHC序列的繁衍浅析一下判断YBX1为独立自主繁衍概率的因素(图1H)。深入一个脚印整合IHC、WB调查和肿癌结构与相邻非肿癌结构的环境转录组学资料集确认YBX1是肝生殖体细胞膜癌治療的暗藏靶点(图1I-K)。
图1:YBX1被选定为调控HCC内部糖酵解的主要情况
02、YBX1利于HCC中的有氧糖酵解和增值能力
为了研究YBX1在调控HCC糖酵解中的作用。构建YBX1敲低细胞系,靶向治疗势能分解代谢组学检测,敲低后糖酵解途径的几个关键中间体显著减少,三羧酸(TCA)循环中间体的水平也降低了(图2A-D);结合葡萄糖碳示踪法、细胞外酸化率检测等实验证实YBX1敲低后,糖酵解活性受损,葡萄糖摄取和乳酸分泌减少,抑制HCC细胞增殖(图2E-K)。
图2:YBX1提高网站HCC中的有氧糖酵解和增值能力
03、OGT与YBX1结合起来并提高YBX1的O-GlcNAc糖基化
为了识别YBX1的调控因子,蛋清互作组分析显示YBX1与O-GlcNAc转移酶(OGT)相互作用,并结合Co-IP和共定位进行验证(图3A–E)。进一步创建了一个OGT K908A突变体,利用O-GlcNAc糖基化激活剂、抑制剂OSMI-1判断YBX1的O-GlcNAc糖基化的变化(图3F-H),结构域分析OGT的TPR结构域对于与YBX1的结合至关重要(图3I-L)。免疫沉淀YBX1的质谱分析揭示了六个潜在的O-GlcNAc糖基化位点,并结合点突变和分析证实T57是YBX1上关键的O-GlcNAc糖基化位点(图3M-O)。
图3:OGT与YBX1通过并驱动YBX1的O-GlcNAc糖基化
04、YBX1的O-GlcNAc糖基化提升其磷过酸,然而促使其核转位
进三步在线检测YBX1的O-GlcNAc糖基化是否能够损害其磷酸性反应,在OGT敲低的HCC组织上皮细胞中或用OGT减缓剂OSMI-1正确外理,YBX1血清横向取得拉低,YBX1磷酸性反应取得减小(图4A-C)。IP检测呈现,在是一样的的Flag-YBX1底物横向下,YBX1-WT的磷酸性反应横向取得高过YBX1-T57A,显示磷酸性反应的增多往往仅是会因为越来越高的YBX1血清表明(图4D)。分割了核和质酚类化合物显示TMG正确外理的HCC组织上皮细胞中YBX1核表明的偏高(图4E-F),进三步显示YBX1磷酸性反应的重点调接系数是AKT(图4G-I)。此类显示重视O-GlcNAc糖基化可以通过加快会其磷酸性反应来改善YBX1血清安稳性并加快会核转位。
图 4.YBX1的 O-GlcNAc 遮盖不要有利其进每一步引发磷碱化遮盖并可以可以淡化其核转位
05、YBX1促使PKM2转录
前期结果表明YBX1 O-GlcNAc糖基化通过增强糖酵解和细胞增殖促进HCC进展。为了研究YBX1如何调控糖酵解,我们在HCC细胞中进行了转录组测序分析,糖酵解相关基因集在YBX1敲低细胞中显著抑制(图5A-B)。RNA 测序数据和 CUT&Tag 数据集以及ChIP-qPCR、QRT-PCR 分析表明PKM2 和 LDHA 是 YBX1 的直接转录靶标(图5C-H)。
图 5.YBX1力促PKM2转录
06、YBX1 够提生组淀粉酶乳酸性反应遮盖能力
研究探讨出现 YBX1敲低有效影响核苷酸质乳碱化,更是是H3K18乳碱化(图6A-C)。糖酵解能够抑注射剂2-DG的科学实验确认了糖酵解与组核苷酸乳碱化的单独微信关联,能够抑制性糖酵解可有效影响H3K18la能力(图6D)。PKM2过抒发可逆性转YBX1敲低所至的H3K18la的降低,以外源乳酸治疗既升降H3K18la,还陪伴YBX1抒发调整,表示出现正面反馈机理(图6E-G)。CUT&Tag与ChIP-PCR确认,H3K18la利用丰度于YBX1运行子单独加速其转录,该具体步骤受O-GlcNAc糖基化改善(图6H-J),并出现 P300 调整是YBX1增强学习H3K18乳酰化做用的机理(图6K-L)。
图6.YBX1怎强H3K18乳硝化作用淡化品质
新闻稿件个人心得体会
在一种项研究探讨中媒体报道了YBX1在HCC中高呈现,和与糖酵解密码切涉及到的。YBX1在T57处被O-GlcNAc装饰,以此安全核高蛋白质并上升其呈现。各种装饰还加快YBX1在T57处的磷硝化作用,加快其核易位。所以,一种的时候增强学习了糖酵解涉及到的表观遗传的转录并兴奋乳酸的有。因此,YBX1启用P300的转录,行而驱动软件组核蛋白质的乳硝化作用,独特是H3K18la,H3K18乳硝化作用正在向管控YBX1表观遗传转录(图7)。
图7.Y糖酵解-表观遗传基因正负极馈环长效机制图
拜谱工作小结
本研究结合了单细胞转录组、空间转录组的数据,利用转录组、蛋白互作组、代谢组以及多种分子实验揭示了一个YBX1-糖酵解-H3K18la 的反馈回路,驱动HCC进展,并提示针对HCC代谢的潜在治疗策略。拜谱微生物为该研究提供了转录组测序,蛋白质互作组和靶点消耗的能量细胞代谢组技术服务,拜谱海洋生物建立了完善成熟的转录组学、核蛋白组学、翻意后表达组学、消化吸收组学以及多组学联合产品技术服务体系,助力发表高分文献,欢迎致电咨询!
参考资料学术论文
Ji Y, Xu Z, Tang L, Huang T, et,al.. O-GlcNAcylation of YBX1 drives a glycolysis-histone lactylation feedback loop in hepatocellular carcinoma. Cancer Lett. 2025 Oct 28;631:217957. doi: 10.1016/j.canlet.2025.217957. Epub 2025 Jul 26. PMID: 40721081.