在人类细胞中，DNA充满了组蛋白、RNA和染色质相关蛋白，形成粘性凝胶。在任何给定时刻，只有蛋白质组的一个子集可以结合DNA并组织其结构、转录、复制、修复和其他基本分子功能。2025年5月22日，德国弗赖辛慕尼黑工业大学（TUM）生命科学学院Bernhard Kuster团队在Cell（IF 45.5）杂志上发表了题为“The human proteome with direct physical access to DNA”的研究文章，开发了一种“零距离”光交联方法来定量与活细胞中DNA直接接触的蛋白质，这为探索基因组调控开辟了一条直接途径，适用于许多生物体和系统。

研究分析最后

1、从光敏锻炼細胞中获取DNA化学交联淀粉酶质

要想分割光热塑血清质-DNA和好物中用LC-MS开展阐述，我搭建没事种性质发生变化纯化手段，可从DNA中去如果不是热塑血清质，仅在影响时在直接的上色体组玩生物富集DNA热塑血清质。用TRIZOL导入上色质并除去执行死刑获的非热塑血清，最后将其立即溶解出来以开展RNase肠蠕动。在彩超截取得出血清质热塑DNA的导入物，在硫氰酸胍中烧开性质发生变化，并在二钝化硅离心法柱上较大洗洁以去如果不是热塑血清质早以完毕。在核酸酶处理从DNA中挥发光热塑血清，并开展胰血清酶肠蠕动中用LC-MS开展阐述。该手段定名为血清质热塑DNA导入或XDNAX。

图1.淀粉酶质交连DNA分离出或XDNAX流程步骤图（图源：Trendel, et al., Cell 2025）

2、可随便玩DNA的胆固醇质图谱

将光热塑方法步骤技术应用于MCF7肿瘤血细胞，发现了了1,805种得票率血清，这其中1,191种现实存在于3个或很多次重复使用中。60%的DNA相护反应组代有核酸综合的GO引用，在缺少核酸综合引用的血清质中，比较大的提供来源于核纤层血清，2是体验固色质团体和肿瘤血细胞裂变的血清质（图2）。

图2 . 可随时排斥 DNA 的蛋白酶质（改自：Trendel, et al., Cell 2025）

图3总的了DNA能够 的功效组所抽象性的淀粉酶质-DNA表面非常含有的核苷酸交连肽。这具有主要是因为（1）球状DNA依照实际形式域、（2）DNA 依照实际无章区（IDR）和（3）主要是因为与别的淀粉酶质（列如 组淀粉酶依照实际淀粉酶）、RNA（列如 剪接指数）或相拆分区室（列如 核仁淀粉酶）能够 的功效而造成的的条件比较接近于。

图3 . 可可以直接接触到 DNA的结构类型域（改自：Trendel, et al., Cell 2025）

3、化学发光法上皮细胞扰动哺乳期间与DNA依照的转录细胞因子

雌缴素多巴胺受体α（ESR1）驻滞留胞质溶胶中，终究会遭到其配体，重置易位到生殖血神经细胞，在哪儿它与什么是基因组中的不同区域环境通过以激活卡不同的转录程度。将血清饥饿的MCF7生殖血神经细胞曝光于高用量雌缴素（10 nM 17β-雌二醇）4两半小时，与养成工作的对比生殖血神经细胞相对这些的DNA相护功效组（图4A）。之中，雌缴素刺激到后DNA相护功效组中的ESR1加大了30倍（图4B）。总的一般来说，在1,814个按量的蛋清质-DNA相护功效中，约有9%展现出多于2倍的差异性变化规律，并观查到与ESR1体现了相护功效的蛋清如POLR2A和SMARCA4等（图4B-C）。

图4 雌雌性激素清理乳线癌组织 DNA 上下级做用组的按量对比（图源：Trendel, et al., Cell 2025）

总结

探讨开启dna组的核氨基酸以了解一下它是是怎样的被读入并付诸操作的，一直都在是科技人工这个暂时的喜欢。dna组可及性大部分以DNA为中心的的度角来探讨，只不过，到日前 ，印染质疑胶中的哪方面的核氨基酸与DNA 发生生物学双方用尚不了解。实用零距光热塑，可看见DNA双方用组中的大部份数核氨基酸，XDNAX技木将做为核氨基酸-DNA双方用探讨的强大的设备。

拜谱个人心得体会

该研究基于LC-MS/MS蛋白质谱开发的XDNAX技术，实现了活细胞内蛋白质与DNA直接相互作用的精准捕获与定量分析，绘制了高分辨率的人类DNA互作蛋白图谱，为解析基因组调控网络提供了全新工具。拜谱生物作为一家国内领先的多组学服务公司，可提供完善成熟的球核苷酸组学、表达组学、排泄组学、转录组学等多组学产品技术服务体系，整合多组学数据进行深入挖掘分析，全面解析机制机理等，助力高分文章发表。欢迎咨询！

参看期刊论文：

Trendel J, Trendel S, Sha S, Greulich F, Goll S, Wudy SI, Kleigrewe K, Kubicek S, Uhlenhaut NH, Kuster B. The human proteome with direct physical access to DNA. Cell. 2025 May 14:S0092-8674(25)00507-0. doi: 10.1016/j.cell.2025.04.037.